Lær mer om Paenibacillus-stammen VT 400
Sommeren 2016, på det årlige møtet i American Society for Microbiology, samles forskere for å dele og diskutere funn relatert til bakterier og menneskers helse.
Blant funnene rapporterte en gruppe på hele genomet, eller det komplette settet av gener, for en bakterie kalt Paenibacillus-arterstammen VT 400 (PVT400). Disse bakteriene hadde tidligere vært funnet i spytt av en pediatrisk pasient med akutt lymfoblastisk leukemi (ALL).
Den detaljerte informasjonen fra denne og fremtidige studier vil hjelpe forskerne til å lære om disse bakteriene kan ha en rolle i menneskers sykdom, særlig hos personer med akutt leukemi som utvikler lungebetennelse eller blodinfeksjoner.
Lungebetennelse hos personer med kreft
Lungebetennelse er den ledende dødsårsaken hos kreftpatienter med nøytropeni, og spesielt de med akutt leukemi. Neutropeni er et lavt antall neutrofiler i blodnutrofiler er hvite blodlegemer som er viktige for å hjelpe kroppen til å bekjempe infeksjon .
Nedre luftveisinfeksjoner er svært vanlige blant kreftpatienter, med enkelte rapporter som viser at 13 til 31 prosent av leukemipasienter som mottar kjemoterapi og opptil 80 prosent av hematopoietiske stamcelle-transplantasjonsmottakere vil oppleve minst en episode av lungebetennelse.
Neutropenisk lungebetennelse er potensielt livstruende infeksjoner. I slike tilfeller begynner leger umiddelbart antibiotikabehandling uten å vente på laboratorieresultater for å bekrefte og spesifisere typen bakteriell infeksjon - fordi det er så viktig å starte behandlingen samtidig, for å redusere risikoen for at pasienten vil bukke for infeksjonen.
Faktisk brukes forebyggende terapi under visse omstendigheter, som er beskrevet nedenfor.
Nylige fremskritt i styringen av nøytropenisk lungebetennelse er et spranghåp om bedre resultater. Flere medisinske samfunn har utstedt oppdaterte retningslinjer for antibiotikabehandling av mistanke om nøytropenisk lungebetennelse.
Og det er mulig at nyere agenter som fremmer kroppens respons på infeksjon, kan ytterligere forbedre aktiviteten til antibiotika.
Fokusere på patogener hos pasienter med nøytropeni
Retningslinjer fra American Society of Clinical Oncology (ASCO) anbefaler at leger forsøker å forhindre infeksjon hos poliklinikker med dyp nøytropeni, men ingen feber. Antibakteriell og antifungal behandling anbefales hvis nøytrofiler forventes å ligge under 100 / μl i mer enn syv dager. Retningslinjen sier at det foretrukne middelet for antibakteriell forebyggende terapi er en oral fluorokinolon, mens den for antifungal terapi er en oral triazol.
Pasienter med nøytropeni er utsatt for et mye bredere utvalg av patogener enn deres motstykker. Det kan være nyttig for leger å vurdere hvor bakteriene kom fra å forutse hvilke antibiotika de sannsynligvis vil være resistente overfor, og hvilke strategier som mest sannsynlig vil være mest effektive.
Paenibacillus Arter
Mot den måten har forskere studert PVT400, de nye bakteriene isolert fra leukemipatienten, medlem av Paenibacillus-slaget - en familie av stavformede bakteriearter. Ulike arter i denne gruppen er blitt isolert fra jord, vann, planter, melk og andre steder.
Imidlertid var ikke Paenibacillus-arter kjent for å forårsake menneskelig sykdom. .. til de siste rapportene viste mulig involvering av tre forskjellige Paenibacillus-arter i humane sykdommer.
Etter at PVT 400 ble isolert fra spytt av en pediatrisk pasient med akutt lymfoblastisk leukemi , viste tidlig studier noen likhet med disse isolatene med amylolyticus-artene, som finnes i larvens hindgut av flyet; men til dags dato er det fortsatt sant at P. amylolyticus ikke har blitt påvist hos mennesker, og videre studier viste forskjeller mellom stamme-VT 400-bakteriene funnet i kreftpasienten og andre P.
amylolyticus stammer.
Så, da forskerne studerte hele VT 400-genomet, var det en rekke interessante funn. Det hadde gener som koder motstandsmekanismer til kjemoterapi- stoffer, som tunicamycin og bleomycin. De fant også gener for bakteriepumper assosiert med multidrugresistens, samt gener som koder for resistens mot antibiotika, inkludert vancomycin, fosmidomycin, tetracyklin samt penicillinlignende stoffer, eller beta-laktamene.
Forfatterne av denne genomstudien bemerket at den komplette genomsekvensen av Paenibacillus sp. stamme VT 400 vil bidra til å bestemme rollen som Paenibacillus-arter i humane sykdommer og gi innsikt i sammensetningen av de normale bakteriene som lever hos pasienter med blodkreft.
kilder:
> Evans SE, Ost DE. Lungebetennelse i pasienten med nøytropenisk kreft. Curr Opin Pulm Med . 2015; 21 (3): 260-271.
Rybakova D, Wetzlinger U, Müller H, et al. Fullstendig genomsekvens av Paenibacillus polymyxa stamme SB3-1, en jordbåren bakterie med antagonistisk aktivitet mot plantepatogener. Genommelding . 2015; 3 (2): e00052-15.
De Souza R, Sant'Anna FH, Ambrosini A, et al. Genome av Pseudomonas sp. FeS53a, en formodet plantevekstfremmende bakterie assosiert med ris dyrket i jernbelastet jord. Genommelding. 2015, (2): e00248-15. 10,1128 / genomeA.00248-15.
Spence R, Demchick P, Hornitzky M, et al. Overvåkning av New Zealand apiaries for Paenibacillus alvei. NZ Entomol . 2013; 36: 82-86.
Kim KK, Lee KC, Yu H, et al. Paenibacillus sputi sp. nov., isolert fra sputum hos en pasient med lungesykdom. Int J Syst Evol Microbiol . 2010; 60: 2371-2376.
Mulcahy N. Ny ASCO Retningslinje for nøytropeni og feber. Medscape Medical News. 16. januar 2013. Tilgjengelig på http://www.medscape.com/viewarticle/777736.
Blomster CR, Seidenfeld J, Bow EJ, et al. Antimikrobiell profylakse og poliklinisk behandling av feber og nøytropeni hos voksne behandlet for malignitet: American Society of Clinical Oncology Clinical Practice Guideline . J Clin Oncol . 2013; 31 (6): 794-810.