Hva er PCR-analyse?
Polymeraskjedereaksjon (PCR) analyse er en laboratorieteknikk designet for å identifisere små mengder DNA i en prøve ved en prosess kjent som amplifisering . Under PCR-amplifikasjon kopieres DNA av interesse flere ganger til det er nok av det til analyse og deteksjon. For eksempel kan PCR brukes til å identifisere små mengder DNA fra organismer som forårsaker gonoré eller klamydia som er tilstede i en urinprøve .
Hvordan virker PCR?
Det første trinnet i PCR er å varme prøven slik at det dobbeltstrengede DNA skiller seg i to enkle tråder - dette kalles denaturering . Da blir primere , korte prøver av DNA som matcher opp til enden av DNA-sekvensen av interesse, kombinert med prøven DNA. Etter dette blir en DNA- polymerase brukt til å starte DNA-replikasjon ved primerplasseringen. Endelig oppvarmes DNA'et for å separere strengene en gang til, og hele PCR-prosessen begynner igjen.
Mengden av DNA-segmentet av interesse som er tilstede i prøven øker eksponentielt med hver PCR-syklus: en kopi blir to, blir deretter fire, blir deretter åtte, etc; så generelt er det bare 20 til 40 sykluser som trengs for å avgjøre om det aktuelle DNA er tilstede (og, hvis det er, å gi en tilstrekkelig prøve for analyse).
Alle trinnene i en polymerasekjedereaksjon - denaturering av DNA, påføring av primerne og forlengelse av DNA - skjer ved forskjellige temperaturer, så etter at den opprinnelige blanding er satt sammen, kan trinnene styres gjennom en prosess kjent som termosyklus , der temperaturen holdes på nødvendige nivåer for bare lenge nok for hvert trinn å finne sted.
Dermed er PCR en effektiv måte å amplifisere mengden av mål-DNA i et enkelt reagensrør med lite behov for menneskelig inngrep.
Polymerasekjedereaksjonen representerte en revolusjon i biologisk teknikk da den ble utviklet tidlig på 1980-tallet, og PCRs skaperen, Kary Mullis, vant Nobelprisen i kjemi for sitt arbeid i 1993.
Hvorfor er PCR Relevant for STD Testing?
Polymerasekjedereaksjon og tilhørende teknikker som ligasekjedereaksjon , viser seg å være av voksende betydning for STD-testing. Dette skyldes at disse teknikkene direkte kan identifisere små mengder virus DNA eller RNA i prøver. Identifisering av et patogenes genetiske kode krever ikke at patogenet er i live - som bakteriekultur eller viral kultur . Det krever heller ikke at infeksjonen har skjedd lenge nok for lenge siden for at folk har utviklet en påviselig antistoffreaksjon (som detekteres av ELISA .) Dette betyr at PCR-teknikker noen ganger kan oppdage sykdommer tidligere enn andre tester, og uten så mye trenger å være opptatt av å holde prøver levende eller test på akkurat riktig tidspunkt.