Fluorescens i situ-hybridisering
Fluorescens in situ hybridisering (FISH) er en av flere teknikker som brukes til å søke i cellens DNA, på jakt etter tilstedeværelse eller fravær av bestemte gener eller deler av gener.
Mange forskjellige typer kreft er forbundet med kjente genetiske abnormiteter. Og ved genetisk snakker vi ikke bare om arvelighet. Over en levetid kan celler gjøre feil når de deler og vokser.
Mutasjoner i DNA som er assosiert med kreft, kan akkumulere i disse cellene.
Hvordan jobber FISH?
FISH er en teknikk som bruker fluorescerende sonder til å oppdage bestemte gener eller deler av gener (DNA-sekvenser). Medisinsk laboratoriepersonell og onkologer bruker FISH til å vurdere pasienter som kan ha kreft, og noen ganger å overvåke en pasient som allerede har blitt diagnostisert med kreft og behandlet.
FISH kan gjøres ved bruk av ulike typer prøver i henhold til plasseringen og type kreft mistenkt: Tumorceller oppnådd fra perifert blod, fra en benmargbiopsi eller fra en lymfeknudebiopsi, og formalin-fastparaffin-innebygd vev (dette refererer til en prøve av vev som er behandlet i laboratoriet og innebygd i en type voks, noe som gjør den mer stiv, slik at den kan skives i tynne seksjoner og monteres for visning under mikroskopet).
Hva betyr bokstavene?
"H" i FISH refererer til hybridisering.
I molekylær hybridisering brukes en merket DNA- eller RNA-sekvens som en sonde - visualiser en rød Lego murstein, om du vil. Sonden brukes til å finne en motstykke Lego murstein, eller DNA-sekvens, i en biologisk prøve.
DNA i prøven din er som hauger av Lego murstein, og de fleste mursteinene i disse haugene stemmer ikke overens med vår røde sonde.
Og alle mursteinene dine er pent organisert i 23 par mursteinbunger - hver haug er en av de sammenkoblede homologe kromosomene, mer eller mindre. I motsetning til Lego-murstein er vår røde Lego-sonde som en sterk magnet og finner sin kamp uten å måtte sortere gjennom haugene.
"F" refererer til fluorescens. Vår røde sonde kan gå seg vill i hauger av murstein, så den er merket med farget fluorescerende fargestoff, slik at det vil gløde. Når den finner sin kamp blant de 23 parede haugene, viser en fluorescerende tag sin plassering. Så, nå kan du se hvordan forskere og klinikere kan bruke FISH til å identifisere hvor (hvilket haug eller hvilket kromosom) et bestemt gen er plassert for et gitt individ.
"I" og "S" står for in situ . Dette refererer til det faktum at vår røde Lego murstein ser etter kampen i prøven du ga .
Hva om spesifikke blodkreftere?
FISH og andre in situ hybridiseringsprosedyrer brukes til å diagnostisere en rekke kromosomale abnormiteter - endringer i det genetiske materialet, forandringer i kromosomer, inkludert følgende:
Sletting - en del av et kromosom er borte
Translokasjon - del av ett kromosom bryter av og stikker på et annet kromosom
Inversion - en del av et kromosom bryter av og setter på nytt inn, men i omvendt rekkefølge
Duplisering - En del av et kromosom er tilstede i for mange kopier i cellen
Hver type kreft kan ha sitt eget sett med kromosomale forandringer og relevante prober. FISH hjelper ikke bare med å identifisere de første genetiske endringene i en sykdomsprosess som kreft, men det kan også brukes til å overvåke respons på terapi og sykdomsreduksjon.
De genetiske endringene som FISH oppdager, gir noen ganger tilleggsinformasjon om hvordan en persons kreft er sannsynlig å oppføre seg, basert på det som tidligere er observert hos personer med samme type kreft og lignende genetiske endringer. Noen ganger brukes FISH etter at diagnosen allerede har blitt gjort, for å hente tilleggsinformasjon som kan bidra til å forutsi pasientens utfall eller beste behandling.
FISH kan identifisere kromosomale abnormiteter i leukemier , inkludert i kronisk lymfocytisk leukemi (CLL). For kronisk lymfocytisk leukemi / lite lymfocytisk lymfom lar FISH pasientene å finne ut sin prognostiske kategori: bra, mellomliggende eller fattige. Ved akutt lymfoblastisk leukemi (ALL) kan genetikk i leukemiccellene fortelle deg om risikonivået for kreft og bidra til å veilede terapeutiske beslutninger.
FISH-paneler er også tilgjengelige for lymfom, multiple myelom, plasmacelleproliferative forstyrrelser og myelodysplastisk syndrom. I tilfelle av mantelcellelymfom, for eksempel, er det en translokasjon som FISH kan oppdage kalt GH / CCND1 t (11; 14) som ofte er forbundet med dette lymfom.
Hvorfor FISH?
En fordel ved FISH er at den ikke må utføres på celler som deles aktivt. Cytogenetisk testing tar vanligvis omtrent tre uker, fordi kreftcellene må vokse i laboratorieretter i ca 2 uker før de kan testes. I motsetning til dette er FISH-resultatene vanligvis tilgjengelige fra laboratoriet innen få dager.
> Kilder:
> Kreft Cytogenetisk Testing CPT-koder.
> Fluorescens i situ-hybridisering (FISH). http://www.genome.gov/10000206#al-2.
> Fluorescens i situ-hybridisering (FISH). http://www.nature.com/scitable/topicpage/fluorescence-in-situ-hybridization-fish-327.
> Wolff DJ, Bagg A, Cooley LD, et al. Veiledning for fluorescens i situ Hybridiseringstesting i hematologiske forstyrrelser. Journal of Molecular Diagnostics: JMD. 2007, 9 (2): 134-143.