Genetiske stammer av HIV-1 og HIV-2

Emerging Rekombinant Stammer Fortsett å utfordre forskere

En av de primære hindringene for å behandle eller utvikle effektiv vaksine for HIV er det høye genetiske mangfoldet av selve viruset. Mens virus som bruker dobbeltstrenget DNA for å replikere, er relativt stabile, går retrovirus som HIV tilbake i replikasjons syklusen (ved bruk av enkeltstam-RNA) og er langt mindre stabile. Som følge av dette er HIV svært utsatt for mutasjon , og bruker faktisk en million ganger oftere enn celler som bruker DNA.

Siden virusets genetiske mangfold utvides og ulike virale deltyper blir overført fra person til person, kan det blandede genetiske materialet skape nye HIV-hybrider. Mens de fleste av disse hybrider dør, viser de få overlevende ofte større motstand mot HIV-terapi og i noen tilfeller raskere sykdomsprogresjon.

Hivets variabilitet skaper derfor noe av et "bevegelige mål" for forskere, med nye rekombinante (kombinert genetiske) stammer som er i stand til å motstå eller helt unnslippe nøytraliserende midler. Noen, som A3 / 02-stammen identifisert av svenske forskere i 2013, er i stand til å tømme en persons immunforsvar langt mer aggressivt enn tidligere kjent stammer.

Hva er HIV-1 og HIV-2?

Det finnes to typer HIV: HIV-1 og HIV-2. HIV-1 regnes som den dominerende typen, som representerer de aller fleste infeksjoner over hele verden, mens HIV-2 er langt mindre vanlig og primært konsentrert i vest- og sentralafrikanske regioner.

Mens begge disse HIV-typene kan føre til aids , er HIV-2 mye vanskeligere å overføre og langt mindre virulent enn HIV-1.

Innenfor hver av disse HIV-typer er en rekke grupper, undertyper ("clades") og sub-subtyper. Utvilsomt vil andre subtyper og rekombinante stammer bli oppdaget ettersom den globale spredningen av HIV fortsetter.

HIV-1-grupper og undertyper

HIV-1 er delt inn i fire grupper: Gruppe M (betyr "major"); Gruppe O (som betyr "outlier" eller over hvor andre grupper er sett); og gruppe N (som betyr "ikke-M" og "ikke-O"); og gruppe P (som betyr "ventende"). De fire forskjellige gruppene er klassifisert av de fire forskjellige simian immundefekt virusene (SIV) som var kjent for å bli overført fra aper eller sjimpanser til mennesker.

HIV-1 Gruppe M

HIV-1 Gruppe M var den første gruppen som ble identifisert, og representerer i dag omtrent 90% av hiv-tilfellene over hele verden og kan finnes nesten i alle deler av verden. Innenfor denne gruppen er det 10 undertyper, som kan stratifiseres blant annet av deres geografiske distribusjon og deres innvirkning på ulike risikogrupper .

HIV-1 Gruppe O

HIV-1 Gruppe O ble oppdaget i 1990 og representerer bare 1% av infeksjonene over hele verden.

Denne HIV-gruppen er isolert i Kamerun og nabolandene i Afrika.

HIV-1 Gruppe N

HIV-1-gruppe N ble oppdaget i 1998, og igjen har det bare blitt sett i Kamerun med mindre enn 20 tilfeller dokumentert til dags dato.

HIV-1-gruppe P

HIV-1 Gruppe P er sjelden type HIV, først identifisert i en kvinne fra Kamerun i 2009. Den kan differensieres fra andre HIV-grupper i den grad opprinnelsen har vært knyttet til en form for SIV som finnes i vestlige gorillaer. Selv om klassifiseringen "P" var ment å utlede en "ventende" status (dvs. venter på bekreftelse av ytterligere infeksjon), ble en andre dokumentert sak identifisert i 2011 hos en kameramansk mann.

HIV-2-grupper

Selv om tilfeller av HIV-2 er blitt identifisert andre steder, er infeksjoner nesten utelukkende sett i Afrika. Det er for tiden åtte HIV-2-grupper, men bare undertyper A og B er de eneste som anses som epidemier. HIV-2 antas å ha kryssede arter fra en type SIV som påvirker sooty mangabeys apen direkte til mennesker.

HIV-2-gruppe A er hovedsakelig sett i Vest-Afrika, men internasjonal reise har ført til en liten håndfull dokumenterte tilfeller i USA, Europa, Brasil og India. Derimot har HIV-2 Gruppe B vært begrenset til deler av Vest-Afrika.

kilder:

Sharp, P. og Hahn, B. "Opprinnelser til HIV og AIDS Pandemic." Cold Springs Harbour Perspectives in Medicine. September 2011; 1 (1): a006841.

Palm A .; Esbjörnsson, J .; Månsson, F .; et al. "Faster progresjon mot AIDS og aids-relatert død blant seroincident individer smittet med rekombinant HIV-1 A3 / CRF02_AG sammenlignet med sub-subtype A3." Journal of Infectious Diseases. 1. mars 2014; 209 (5): 721-728.

Vallari, A .; Holzmayer, V .; Harris, B .; et al. "Bekreftelse av straffende HIV-1 gruppe P i Kamerun." Journal of Virology. Februar 2011; 85 (3): 1403-1407.

Abecasis, A .; Wensig, A .; Paraskevis, D .; et al. "HIV-1-subtypedistribusjon og dens demografiske determinanter i nylig diagnostiserte pasienter i Europa tyder på svært compartmentaliserte epidemier." Retrovirologi. 14. januar 2013; 10: 7; doi: 10.1186 / 1742-4690-10-7.